活性炭过滤器在水处理工艺中，用于对有机物的吸附和对过量氯（余氯）的吸附去除，对前者去除能力较差，通常为50 %，对后者则很强，可以完全脱除余氯，这是由于在对余氯吸附的同时，还有自身被氯化的作用。
活性炭的吸附能力曾被用于口服对肠道细菌的吸附而治疗细菌性痢疾 ，在第一次世界大战中，氯气类毒气作为大规模杀伤性武器被使用 ，活性炭则是防毒面具 中主要的毒气吸附剂，离子交换树脂被广泛应用后，在化学除盐系统中使用较广，大机组对有机酸的腐蚀敏感，因此配置活性炭床者更多。吸附水中营养物质，可以成为细菌微生物的温床 ，微生物膜对水的阻力影响较大 ，因此 ，应定期进行反洗去污。如果反洗不能奏效时 ，应进行灭菌处理。
